在这次攻击中，中华损失了十架海鹰-3但也使得南云忠一的三艘航母失去战斗力，干掉了不少舰队警戒任务的烈风战机。
此时，三艘日本航母由于大火的蔓延，作战能力全面丧失了，特别是同外界通讯被割断了。
赤诚号被命中，南云忠一对部队的指挥中断后，南云部队的次席指挥官、第八巡洋舰战队司令官美国洛维奇少将立即接替指挥。洛维奇的旗舰是阿拉斯加号重巡洋舰。
与此同时，第二航空母舰战队司令官山口多闻海军少将，接替了对空中作战的指挥。第十驱逐舰战队司令官木村进海军少将率领“长良号”轻巡洋舰和六艘驱逐舰，留在受伤的三艘航空母舰附近待帆，进行救援、警戒和掩护-南云部队的其余军舰以飞龙号为中心，继续北撤。，
南云的参谋；长草鹿海军少将主张立即把司令旗移到长良号。南云忠一勉强地点了点头，草鹿耐心地继续恳求说：“长官，盟军大部分军舰完好无损，您务必指挥部队。”
形势要求立即行动，但南云忠一不忍离开他心爱的旗舰。他尤其不愿舍弃在战争中和他一起同甘共苦的赤城号官兵。青木舰长含着眼泪说：“长官，有盟军照管军舰。盟军大家都恳求您把司令旗移列长良号，继续指挥部队。”
这时，副官西林海军大剥过来向草鹿报告：“下面的过道都起火了，逃出去的唯一办法是从舰桥的前窗捋绳子下去，然后从左舷过道绕到抛锚甲板。长良号的汽艇将靠在抛锚甲板左侧，您可扶绳梯下去。”
草鹿又向南云忠一作了离开旗舰的最后清求，南云最后知道无法再从赤城号上继续指挥了，于是跟青木舰长告别，由西林副官扶着爬上舰桥的窗口。参谋长和其他参谋人员以及司令部人员，跟着也离开了舰桥。时间是10点46分。
舰桥上只留下了青木舰长、航海长、飞行长，还有几名水兵。青木拼命设法要跟机房取得联系，航海长忙着查看是否有办法恢复舵机操纵。其他人员都集聚在抛锚甲板上，尽力同大火搏斗。
但是，火舌已经仲到舰桥，烧着了舰桥建筑四周的帆布遮阳篷。飞行长转身对舰长说：“舰长，咱们不能再呆在舰桥上了。您最好赶紧离开，到抛锚甲板上去，要不然来不及了。”
“我是大和民族的男人，大和魂，除非舰艇已经彻底失去任何拯救的机会。”青木的回答，让飞行长无话可说，这是日本海军的传统。
11点30分，南云忠一的幕僚和伤员全都转移到了长良号。这艘巡洋舰开动了，桅杆上飘扬着南云的将旗。
与此同时，赤城号的舰员继续进行努力控制火势。但越来越明显这是不可能的事。当赤城号停车的时候，舰首还朝着顶风方向。为了躲避正在烧到下面机库甲板的火焰，飞行员和其他舰员，都已撤到抛锚甲板。由于发电机停止工作，舰上不仅失去了照明，而且灭火用的水泵也随着不能使用了。机库的防火门已被烧毁，在这种可怕的情况下，化学灭火机也不起作用了。
努力拯救赤城号的舰员找到了几架用手操纵的水泵搬到抛锚甲板上，通过长长的水龙管，把水抽到下面机库和下甲板。肖防人员带着防毒面具，用笨重的消防设备，同大火拼搏。
但是，上甲板每发生一次爆炸，都穿到下面的甲板，伤害了很多人并使他们的殊死的努力受到干扰。这时，另一支损管队踏过倒下去的伙伴的身体赶上来接着奋战，结果又被另一次的爆炸所击倒。救护员和自动参加救护的人员从下面挤满伤员的急救站把死伤人员抬走。医生们象机器一样忙个不停。
机舱没受到损坏，但中段甲板一带的大火切断了舰桥同船的下层之间的一切联系。尽管如此，但是上面的爆炸，震动和坍塌，再加上传令钟已响过“停车”信号，告诉下面的机舱人员某些部分又受到损伤。
但是，只要发动机完好无损，还能使用全速的推进力，他们也别无办法，只能留在战斗岗位上。他们一再想同舰桥联系，但一切联系的途径，包括许多辅助装置，都已被毁了。
烈火继续蔓延，火势越来越猛，热气通过进气孔，窜进军舰最底下的部分，在那里工作的人员开始因窒息而昏倒。为了使部下得救，机电长穿过在燃烧中的甲板，跑上去终于把消息带给了舰长，报告了机舱情况。
青木立即下令全体机电人员马上到甲板上来，但是，已经太晚了。带着这道命令试图穿过火海下去的传令兵一去不返，机舱人员没有一个人幸免。
伤亡不断增加，大火越来越无法控制了。
18点，青木舰长最后决定必须弃舰。伤员转移到掩护的驱逐舰派来停靠在旁的小船和汽艇上。许多没有负伤的人，跳到海里，游泳离开了赤城号。驱逐舰救起了全部幸存人员。
拯救工作结束后，青木舰长于19点20分从一艘驱逐舰拍电给日美联合舰队司令部请求批准将被毁的航空母舰炸沉。蒙大拿号旗舰截收到了这份电报。22点25分，日美联合舰队司令部发出暂缓处置那艘航空母舰的命令。青木舰长接到这一指示后，独自返回赤城号。他回到还没有被大火波及的抛锚甲板，把自己绑在锚上待毙。
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